当前位置 :首页>基因引物

植物叶绿体基因组基因引物序列(七)

发布者:Primerbank 时间:2018-01-30 浏览量:1353


primer name

sequence

Nicotiana

Arabidopsis

Populus

Oryza

Eucalyptus

Acorus

Atropa

Marchantia

Spinacia

Pinus

Oenothera 2

Zea 2

Medicago 2

16S-F

ACGGGTGAGTAACGCGTAAG

102853

101104

102489

91391

105773

99931

103161

82209

98039

84432

106095

95253

27287

IRB19F

CGACACTGACACTGAGAGACGAAAGC

103452

101704

103089

91991

106373

100531

103761

82808

98639

85032

106694

95853

26687

IRB18R

TGAGTTTCATTCTTGCGAACGTACTC

103621

101873

103258

92160

106542

100700

103930

82976

98808

85201

106863

96022

26517

ccSSR-22 R

GGAAGGTGCGGCTGGATC

104224

102476

103861

92763

107145

101303

104533

83578

99411

85804

0

96625

0

16S-R

CTTCCAGTACGGCYACCTTG

104228

102480

103865

92767

107149

101307

104537

83582

99415

85808

107471

96629

25910

ccSSR-22 F

CCGACCTAGGATAATAAGCYCATG

104413

102660

104045

92949

107329

101492

104723

 

99607

83753

0

96811

25713

IRB20F

GGGCTATTAGCTCAGTGGTAGAGCGC

104551

102801

104183

93100

107466

101643

104861

83878

99737

86205

108350

96953

25578

IRB19R

ATCGAAAGTTGGATCTACATTGGATC

104795

103045

104427

 

107708

101886

105105

 

99981

 

108592

 

25335

ccSSR-16 F

TACGAGATCACCCCTTTCATTC

104961

103220

104602

93517

107884

102093

105280

 

100149

 

109857

97371

25158

IRB21F

GAGGTCTCTGGTTCAAGTCCAGGATG

105299

103571

105172

94088

108459

102626

105618

84805

100511

87232

109338

97943

24848

IRB20R

CAAGAGCGGAGCTCTACCAACTGAGC

105428

103699

105306

94217

108593

102759

105747

84946

100646

87390

109467

98072

24717

IRB22F

AGATTTTGAGAAGAGTTGCTCTTTGG

106003

104367

105975

94894

109262

103423

106294

 

101328

 

110129

98743

24032

IRB21R

ATAAGCGGACTCGAACCGCTGACATC

106170

104533

106141

95062

109429

103591

106461

85747

101498

88197

110296

98911

23870

IRB23F

GAAACTAAGTGGAGGTCCGAACCGAC

107054

105416

107024

95948

110316

104475

107345

86637

102380

89077

111175

99797

22969

IRB22R

TAGATGTCCAGTCAACTGCTGCGCCT

107193

105555

107163

96087

110455

104614

107484

86776

102519

89216

111314

99936

22830

IRB24F

GGTCTCCGCAAAGTCGTAAGACCATG

108131

106493

108100

118024

111393

105551

108422

87720

103456

90144

112252

100941

21901

IRB23R

CGCTACCTTAGGACCGTTATAGTTAC

108278

106640

108247

97240

111540

105698

108569

87866

103603

90291

112399

101088

21754

IRB25F

CTGCTGAAAGCATCTAAGTAGTAAGC

109089

107451

109058

98048

112351

106510

109382

88673

104414

 

113210

101897

20947

IRB24R

ACATCACTGCACTTCCACTTGACACC

109303

107662

109269

98248

112562

106721

109596

88893

104643

91319

113412

102097

20735

ccSSR-17 F

CACACCAATCCATCCCGAACT

109627

107977

109564

98542

112854

107006

109920

89185

104973

91627

113694

102394

20447

NTCP39-r

GACGATACTGTAGGGGAGGTC

109671

108021

109608

98586

112898

107050

109964

 

105017

91671

113738

102438

20403

ccSSR-21 R

AAAAATAGCTCGACGCCAGGAT

109698

108048

109635

98613

112925

107077

109991

89256

105044

91698

113765

102465

20376

NTCP37-r

CAGGATGATAAAAAGCTTAACAC

109714

108064

109651

98629

112941

107093

110007

 

105060

91714

113780

102481

20360

NTCP39-f

GTCACAATTGGGGTTTTGAATA

109826

108162

109749

 

113050

107199

110123

 

 

 

113883

102593

20258

ccSSR-17 R

GGTGCGTTCCGRGGTGTGA

109862

108197

109785

 

113086

0

110159

 

 

 

113919

 

0

IRB26F

AAATGGCTGGGGAGAGGAAAGGTTCC

109905

108231

109833

 

113129

107290

110202

 

105246

 

113962

 

20179

IRB25R

GGTTGTGGGCGAGGAGGGATTCGAAC

110055

108380

109981

98969

113281

107438

110352

89560

105396

92021

114114

102817

20033

CHTRN

ACAGCCGACCGCTCTACCACTGAGC

110670

109051

110706

99254

113945

107969

110975

90299

105997

92626

114694

103104

19450

IRB27F

TGGCTCTATTTCATTATATTCCATCC

110844

109225

110880

99427

114119

108143

111149

 

106171

 

114870

103278

19314

IRB26R

ATTATCTTCATGCATAAGGATACTAG

111087

109463

111130

 

114363

932

111392

 

106403

 

135663

557

0

ndhF+607

ACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTC

111463

109848

111515

 

114748

109037

111768

 

106788

 

0

 

0

JSB-f1

GGACTAAACAGGAACAAGAGG

111852

110183

111895

 

115138

109457

112157

 

107150

 

0

 

0

IRB27R

AGTGGATCCCTCTTGTTCCTGTTTAG

111880

110211

111923

 

115164

109483

112185

 

107178

 

97088

 

0

ndhF-1259

ATTTCATCTTTGGACCARAARCAAGC

113034

111380

113909

102379

116569

110991

113781

91921

108740

 

116058

106030

96112

ndhF-803

GAAAAATTCCCGCCGCTACCATAG

113467

111813

114342

 

26905

111424

114214

 

109173

 

40803

 

0

ndhF-803R

CTATGGTAGCGGCGGGAATTTTTC

113490

111836

114365

 

26928

111447

114237

 

109196

 

40780

 

0

ndhf-523

TGTCAAAAAGCTTTTGTAWCWAATCG

113770

112116

114651

103115

117305

111727

114517

92657

109476

 

116794

106766

1902

ccSSR-18 F

TCGTTGGATTTCTTCDGGACATTT

116517

114640

116119

 

119878

0

117208

 

 

 

0

 

0

ccSSR-18 R

CCCAATATCATCATACTTACRTGC

116780

114906

116382

 

120141

114735

117471

 

112756

 

119321

 

4261

ccSSR-19 F

CTATGCAGCTCTTTTATGYGGATC

116781

 

116383

 

120142

114736

 

 

112757

 

119322

 

4262

ccSSR-19 R

TCCARGTAATAAATGCCCAAGTT

117115

115283

116741

106034

120500

115094

117803

 

 

105086

119680

109790

0

ccSSR-20 R

GCTAARCAAATWGCTTCTGCTCC

119284

117458

118956

 

122771

0

 

98429

115269

103626

122110

 

0

ndhAR-Small

CTGyGCTTCmACTATATCAACTGTAC

122192

120336

121903

111129

125718

119988

122880

100892

118096

 

124793

114841

9597

ndhAF-Small

GGWCTTCTYATGKCRGGATATRGMTC

123504

121580

123192

 

 

 

124194

101768

119339

 

 

 

 

JSB-f1-R

GGACTAAACAGGAACAAGAGG

130774

128466

130268

 

115138

109457

131400

 

126295

 

0

 

0

ndhF+607-R

ACCAAGTTCAATGTTAGCCAGATTAGTC

131163

128801

130648

 

114748

109037

131789

 

126657

 

0

 

0

CHTRN-r

ACAGCCGACCGCTCTACCACTGAGC

131956

129598

131457

115864

113945

107969

132582

111821

127448

92626

114694

103104

19450

NTCP39-ff

GTCACAATTGGGGTTTTGAATA

132800

130482

132414

 

113050

107199

133434

 

 

 

113883

102593

20258

NTCP37-rr

CAGGATGATAAAAAGCTTAACAC

132912

130585

132512

116489

112941

107093

133550

 

128385

 

113780

102481

20360

NTCP39-rr

GACGATACTGTAGGGGAGGTC

132955

130628

132555

116532

112898

107050

133593

 

128428

 

113738

102438

20403

3'rps12-1F

CCMAAAAAACCMAACTCTGCCTT

141781

82919

141933

125854

103504

97700

142440

94

137347

109716

104123

93092

29159

3'rps12-2F

ATCGTCAACAAGGGCGTTCTAGTG

141983

140067

142135

126056

103302

97498

142642

296

137549

109918

103921

92890

0

3'rps12-3R

GATYGGAAATCCTGTATTTTMCA

142374

98191

142526

126451

102905

97107

143032

78158

95505

110305

103524

92495

56734

3'rps12-4F

GAGATCCACCCTACAATMTGGGG

100100

140611

142678

126603

102749

96955

143184

803

138092

110466

103368

92343

0

rps7-6FF

CTCATAGAATGGCAGAGGCAAATAG

143040

141125

143197

127128

102235

96442

143698

 

138606

 

102842

91818

29887

rps7-6RR

CTATTTGCCTCTGCCATTCTATGAG

143064

141149

143221

127152

102211

96418

143722

 

138630

 

102818

91794

29911

ndhB-7FF

GGAAGTTTSTTTCCCAGAATG

143451

141571

143661

87553

101777

95992

144116

 

115459

 

0

47634

0

ndhB 7RR

CATTCTGGGAAAATSAAACTTCC

143471

141591

143681

127585

101757

95972

144136

 

115479

 

102364

91366

0

ndhB-8RR

GATAGAGGAATACATAGAGTTGAAC

143708

141828

143918

127822

101520

95735

144373

 

139287

 

102127

91129

30510

ndhB-9FF

ATGGTTTCTCTTGGCTATATGG

143951

142071

144161

128065

101277

95492

144616

 

139530

 

101884

90886

30753

ndhB-B10RR

GAAAGCTTGAACCCAATTCCTAC

144098

142218

144308

128212

101130

95345

144763

 

139677

 

101737

90739

30900

ndhB-10RR

CCTTCGTAGACGTCAGGAGTCCATTG

144140

142260

144350

128254

101088

95303

144805

 

139719

 

101695

90697

30942

ndhB-C11RR

TTACACTCGTAGTCTCTGAAG

144456

142580

144666

128591

100772

94966

145121

 

140029

 

101380

90368

31257

ndhB-11FF

GAAGGATTCCTCGAAAAGTTAAGG

144616

142741

144829

128751

100608

94806

145281

 

140189

 

101219

90208

31424

ndhB-11RR

CCTTAACTTTTCGAGGAATCCTTC

144639

142764

144852

128774

100585

94783

145304

 

140212

 

101196

90185

31447

ndhB-12FF

CTTTCTGTTACTTCGAAAGTAGC

144845

142971

145058

128992

100379

94577

145510

 

140419

 

100988

89967

31662

ndhB-13FF

CTCAAACAAGCATGAAACG

144990

143116

145203

129137

100234

94432

145655

 

140564

 

100843

89822

31807

ndhB-13RR

GCATACGTTTCATGCTTGTTTGAG

145013

143139

145226

129160

100211

94409

145678

 

140587

 

100820

89799

31830

ndhB-14RR

GGTATAGTAGATGCTATCACACA

145524

143650

145737

129671

99700

93898

146189

 

141098

 

0

89288

32341

trnIff

TGAATGGTTAAAGCGCCCAACT

153865

152275

154454

131917

91094

86200

154539

 

149185

119404

91610

84943

39084

rpl23p46-2

TAAGACAGAAATAAAGCATTGCGTCGAAC

154185

152598

154774

132246

90770

85879

154859

 

149505

 

91263

58651

39712

rpl2-5'-2

GGAGGTCATAAGCGTCTATACCG

154552

152965

155141

132613

90397

85512

155226

 

149852

 

90896

84255

40044

rpl2-B20FF

GTAACCATAGAATACGACCC

154621

153034

155210

132682

90328

85443

155295

 

149921

 

90827

84186

40113

rpl2-r-F

CCATAGAATACGACCCTAAT

154625

153038

155214

132686

90324

85439

155299

 

149925

 

90823

84182

40117

rpl2m1-2

TTCTATGGTTACGATTCTACCATATATGTC

154632

153045

155221

132693

90317

85432

155306

 

149932

 

90816

84175

40124

rpl2-21FF

CCCTACCTTTGAGTGCGGTTTGAA

154772

153185

155361

132833

90177

85292

155446

 

 

 

90676

84035

40264

rpl2-22R-f

GTCTTCTCCATATTACYATATCT

87637

153403

155578

133050

89960

85075

87894

 

 

 

90458

83818

40481

rpl2-23FF

GCTACATGAAGAACATAAGCCAGATG

155204

153618

155793

133260

89746

84856

155878

 

 

 

90244

83608

40703

rpl2ff

ACCGATATGCCCTTAGGCACGGC

155449

153878

156040

133507

89502

84612

156121

 

150083

 

90003

83361

40973

rpl2-24FF

CAACRATATGCCCTTAGGCAC

155448

153877

156049

133506

89503

84613

156120

 

150082

 

90004

83362

40972

rpl2-24RR

GTGCCTAAGGGCATATYGGTG

155468

153897

156059

133526

89483

84593

156140

 

150102

 

89984

83342

40992

rpl2-3' 2

AGCCAACGCTTAGATCCGGCTCTACC

155693

154122

156284

133751

89258

84368

156365

 

150327

 

89759

83117

0

rpl2-B25RR

GGGTTCATARCTACTCCTCTTAC

155732

154161

156323

 

89219

84329

156404

 

150366

 

0

 

41256

rpl2-25R-f

TTCCAAGYGCAGGATAACCCCA

155821

154250

156412

133879

89130

0

156493

 

150455

 

0

82989

41345

RPL2 Goulding 2

GATAATTTGATTCTTCGTCGCC

155851

154290

156442

133909

89100

84210

156523

 

 

 

89601

82959

41375

NTCP40-ff

TAATTTGATTCTTCGTCGC

155853

154281

156444

 

89098

84208

156525

 

 

 

89599

82957

41377

NTCP36-ff

GTAGTAAATAGGAGAGAAAATAGA

155873

154302

156466

 

89078

0

156545

 

150507

 

38380

 

41404

NTCP36-rr

TTGTAGCCAATCATTTATTAA

 

 

156564

 

88979

83880

156657

 

150610

 

0

 

41607