当前位置 :首页>基因引物

植物叶绿体基因组基因引物序列(五)

发布者:Primerbank 时间:2018-01-30 浏览量:1927

primer name

sequence

Nicotiana

Arabidopsis

Populus

Oryza

Eucalyptus

Acorus

Atropa

Marchantia

Spinacia

Pinus

Oenothera 2

Zea 2

Medicago 2

rps4-M

CCATTAACTAAAATATGTYG

47783

45470

45900

 

49582

46336

47453

54127

44721

 

19137

47404

108655

rpS4R2 Shaw

CTGTNAGWCCRTAATGAAAACG

47958

45645

46075

45232

49757

46511

47628

49847

44897

69711

18962

47579

108830

ucp-a/trnT-f

CATTACAAATGCGATGCTCT

48546

46246

46515

45748

50164

47078

48206

 

45536

69214

18418

48114

109364

trnT(UGU)2F-trnA2

CAAATGCGATGCTCTAACCT

48551

46251

46520

45753

50169

47083

48211

 

45541

69209

18413

48119

109369

trnT-M

AGAGCATCGCATTTGTAATG

48565

46265

46534

45767

50183

47097

48225

 

45555

69195

18399

48133

109383

trnT(UGU)R Shaw

AGGTTAGAGCATCGCATTTG

48570

46270

46539

45772

50188

47102

48230

 

45560

69190

18394

48138

109388

NTCP23-r

TAGCTCAGAGGTTAGAGCATC

48578

46278

46547

45780

50196

47110

48238

50326

45568

69182

18386

48146

109396

ucp-c

CGAAATCGGTAGACGCTACG

49306

46904

47038

46568

51460

47870

48953

 

46222

68739

17261

48976

110650

ucp-b/trnL-r

TCTACCGATTTCGCCATATC

49318

 

47050

46580

51472

47882

48965

50544

46234

2417

17249

48988

110662

ucp-e

GGTTCAAGTCCCTCTATCCC

49862

47469

47687

47161

52019

48449

49503

50900

46579

68198

16688

49487

111056

ucp-d

GGGGATAGAGGGACTTGAAC

49882

47489

47707

47181

52039

48469

49523

50920

46599

68178

16668

49507

111076

trnF-f

CTCGTGTCACCAGTTCAAAT

50280

48215

48061

47465

52248

48881

49927

51038

46977

67757

16247

49912

111225

ucp-f/trnF-r

ATTTGAACTGGTGACACGAG

50299

48234

48080

47484

52267

48900

49946

51057

46996

67738

16228

49931

111244

ndhJ-r

TTTTYATGAAATACAAGATGCTC

51016

48704

48873

48019

0

0

50656

 

47691

 

15470

50562

0

ndhC-f

TCATATTCGTRAAGCAGAAACAT

52645

50341

50511

49640

54699

50964

52285

 

 

 

13835

52195

0

ycf4-r1

CTAATAAGAAGCCTAATGAACC

62749

59883

51457

 

96608

0

62416

 

 

 

65166

59775

34630

trnV2-f

CGAACCGTAGACCTTCTCGG

53771

51215

51854

50383

55252

52915

53417

53067

50027

48032

12483

53174

113959

trnV1-r

CCGAGAAGGTCTACGGTTCG

53790

51234

51873

50402

55271

52934

53436

53086

50046

48013

12464

53193

113978

trnV-P5

AAATGCATGTTGGGTTCTTKRAACAGTTC

53855

51299

51938

50467

0

52999

53501

53137

50111

47948

0

53258

0

trnM-f

TGCTTTCATACGGCGGGAGT

54616

52083

52705

51246

56109

53789

54272

53829

50886

47201

11618

54047

114792

trnM-rr

TTGGATTTGAACCAAYGACTC

54652

52119

52741

51282

56145

53825

54308

53865

50922

47165

11582

54083

114828

atpE-r2

AATCGARTYRTTTGGGATTCAGAAGT

55254

52633

53398

 

56793

54374

54910

 

 

46664

10944

 

115340

atpB-r1

TTTCCGGAGAATTAGATGGTC

55393

52772

53537

51926

56932

54513

55049

54468

51655

46525

10805

54730

115479

atpB-r2

CCGTACTATCAAGAGGATTGGCTG

55729

53108

53873

 

57268

54849

55385

 

51991

 

10469

 

0

atpB Fofana

GTGTCAATCACTTCCATTCC

56497

 

54641

53030

58036

55617

56153

 

52759

45421

9701

55834

0

atpB Samuel

GAAGTAGTAGGATTGATTCTC

56755

54134

54899

53288

58294

55875

56411

 

53017

 

9443

56092

0

ccSSR-10 F

TCTAGGATTTACATATACAACAT

57267

54620

55392

 

58780

56373

56923

 

53494

 

0

 

117301

ccSSR-10 R

CATCATTATTGTATACTCTTTCA

57415

54781

55539

53784

58944

56525

57068

 

53649

 

8907

56574

117455

ccmp7-r

ACATCATTATTGTATACTCTTTC

57416

54782

55540

53785

58945

56526

57069

56232

53650

 

8906

56575

117456

NTCP25-r

CTTTTCATAGGAATCTTTCACA

57515

54862

55636

 

59038

0

57168

 

 

 

6113

 

75890

rbcL Samuel

CCCTACAACTCATGAATTAAG

57586

 

55707

54086

59109

56705

57239

 

 

 

8755

56865

117615

rbcL 5"F-PCR

TTTATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGC

57592

54955

55713

54092

59116

56712

57245

56352

53822

44476

8748

56872

117621

rbcL RH1

ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGC

57595

54958

55716

54095

59118

56714

57248

56355

53825

44473

8746

56874

117623

rbcL Rieseberg (rbcL2f)

ATGTCACCACAAACAGAAACTAAGCAAGT

57595

54958

55716

54095

59118

56714

57248

56355

53825

44473

8746

56874

117623

rbcL Z1

ATGTCACCACAAACAGAGACTAAAGCAAGT

57595

54958

55716

54095

59118

56714

57248

56355

53825

44473

8746

56874

117623

rbcL PR1f

ATGTCACCACAAACAGAGACT

57595

54958

55716

54095

59118

56714

57248

56355

53825

44473

8746

56874

117623

rbcL 5' Tsumura

TGTCACCAMAAACAGAGACT

57596

54959

55717

 

59119

56715

57249

 

53826

44472

8745

 

0

rbcL H1f

CCACAAACAGAGACTAAAGC

57601

54964

55722

54101

59124

56720

57254

56361

53831

44467

8740

56880

117629

rbcL Dumolin

GCTTTAGTCTCTGTTTGTGG

57620

54983

55741

54120

59143

56739

57273

56380

53850

44448

8721

56899

117648

rbcL Z1R

ACTTGCTTTAGTCTCTGTTTGTGGTGACAT

57624

54987

55742

54124

59147

56743

57277

56384

53854

44444

8717

56903

117652

rbcL Hodges

ACTTGCTTTAGTTTCTGTTTGTGGTGA

57624

54987

55745

54124

59147

56743

57277

56384

53854

 

8717

56903

117652

rbcL C34 (M34)

GGATTCAAAGCTGGTGTTAAA

57628

54991

55749

54128

59151

56747

57281

56388

53858

44440

8713

56907

117656

atpB 5' Hoot

GAATCCAACACTTGCTTTAGTCTCT

57633

54988

55754

54133

59156

56752

57286

56393

53861

44435

8708

56912

0

rbcL Z153R

AAGATTCGGCAGCTACCGCGGCCCCTGCTTC

57778

55141

55899

54278

59299

56895

57431

 

54008

 

8565

 

117804

rbcL Savolainen

TACAGTTGTCCATGTACCAG

57801

55164

55922

54301

59324

56920

57454

56561

54031

44267

8540

57080

117829

rbcL M286

CAATATATTGCTTATGTAGC

57880

 

56001

54380

0

56999

57533

56640

 

 

0

 

117908

rbcL M288

ATATATTGCTTATGTAG

57882

 

56003

 

0

57001

57535

56642

 

 

0

 

117910

rbcL M288R

CTACATAAGCAATATAT

57898

 

56019

 

0

57017

57551

56658

50788

 

0

 

117926

rbcL K286 R (H286R)

GCTACATAAGCAATATATTG

57899

 

56020

54399

0

57018

57552

56659

 

 

0

 

117927

rbcL TWNP1

TTACCCTTTAGACCTTTTTGAAGAAGGTTC

57900

55263

56021

 

59423

57019

57553

 

54134

44168

8441

 

117928

rbcL M313

TTAGACCTTTTTGAAGAAGG

57907

55270

56028

55564

59430

57026

57560

 

54137

44161

8434

 

117935

rbcL W296R

CTAAAGGGTAAGCTACATAAG

57910

 

56031

54410

59433

57029

57563

56670

 

44158

8431

57189

117938

rbcL P1R

TCTAAAGGGTAAGCTAC

57911

 

56032

62566

59434

0

57564

 

 

44157

8430

 

0

rbcL Z346R (&K) mims

AAATACGTTACCTACAATGGAAGTAAACAT

57969

 

56090

54469

59492

57088

57622

56729

54199

44099

8372

57248

117997

rbcL Fofana

GTAAAATCAAGTCCACCGCG

58193

55556

56314

 

59716

57312

57846

56953

 

 

8148

57472

118221

rbcL PR3r

CATTTCTTCACATGTACCTGC

58344

 

56465

54844

59867

57463

57997

57104

 

43724

0

57623

0

rbcL Saltonstall

TGTACAAGCTCGTAACGAAGG

 

56238

56996

55375

60398

57994

 

 

55105

43193

0

58154

118903

rbcL PR2r

CCTTCATTACGAGCTTGCACAC

58895

56258

57016

55395

60418

58014

58548

57655

55125

43173

0

58174

118923

rbcL 1360R Reeves

CTTCACAAGCAGCAGCTAGTTC

58975

56338

57096

 

60498

58094

58626

57735

55205

43093

7366

 

119003

rbcL-1382R

CTTCACAAGCAGCAGCTAGTTCAGGACTCC

58975

56338

57096

55475

60498

58094

58628

57735

55205

43093

7366

 

119003

rbcL 3' Tsumura

TTCCATACTTCACAAGCAGC

58982

56345

57103

110331

60505

58101

58635

 

55212

43086

7359

114038

119010

rbcL 1368R Reeves

CTTTCCAWAYTTCACAAGCAGCA

58984

56347

57105

 

60507

58103

58637

57744

55214

43084

7357

 

119012

rbcL 3' ZC

CTTTTAGTAAAAGATTGGGCCGAG

59154

 

57215

 

60612

58259

58807

 

55320

42994

7258

 

119112

accD M

AMRCAAKTSTCGCATTGAACCCA

60544

 

58508

 

61966

 

60201

 

56694

 

 

 

 

accD M2

MCATGTCTTCATCCATAGGAT

60684

57909

58648

 

62106

0

60339

58370

 

42124

88097

13681

67841

ORF512-f

AGTATGGGATCYGTAGTMGG

60852

58077

58814

 

62274

0

60507

58533

57000

 

63476

 

67406

ORF106 Rieseberg (ORF106-r)

ACTACAGATCTCATACTACCCC

60868

58093

58830

56593

62290

0

60523

 

69242

 

63492

 

0

accD-769F

GGAAGTTTGAGCTTTATGCAAATGG

60963

 

58925

 

0

88822

60618

 

 

 

63587

46501

67295

accD-f

GCAGGTAAAAGAGTAATTGAAC

61140

58365

59102

 

62562

83505

60795

101465

57288

41632

63764

 

67118

NTCP26-f

GCAATTGCAATGGCTTCTTTA

62140

59307

60068

57279

63553

59473

61806

 

58144

 

64600

59250

66405

psaI-r

GCAATTGCCGGAAAMACTARGC

62147

59314

60075

57286

63560

59480

61813

 

58151

 

64607

59257

0

psaI-75R

AGAAGCCATTGCAATTGCCGGAAA

62157

59324

60085

57296

63570

59490

61823

 

58161

40816

64617

59267

66388

ORF184-f

TGGCGATCAGAACAYATATGGATAG

62644

59778

60551

57708

64031

59908

62311

 

58559

68439

65063

59672

0

ORF184 Grivet

GGCCYCGGATTTCCATATAAAG

63082

60200

60989

58146

64469

60346

62749

 

87081

39834

65501

60110

116209

ycf4-r3

CTTCAATTGGTACACGCAAGAA

63184

60318

61091

 

92028

60448

62851

 

59099

39732

92504

60215

0

petA-f0

CCCATTTTTGCACAGCAGGGTTATG

64443

 

62516

59709

66600

61985

64644

 

 

37936

67451

61593

64233

petA-r

CCCTCKGAAACAAGAAGTT

65092

62414

63165

60358

67249

62634

65293

 

61407

 

68100

 

63584

petA-f(FOF)

GCATCTGTTATTTTGGCACA

65214

 

63287

60480

67371

62756

65415

 

61529

 

68222

62364

63462

psbJ-B58R

CCAAAGAGGAATCCTTCCAGTRGTAT

66453

63628

64413

61655

68539

63808

66705

 

62514

35981

69461

63437

62270

psbL-f Grivet

GAAAATAAAACAGCAAGTAC

66629

63823

64674

61833

68739

63995

66881

63055

62705

35811

69647

63614

62084

psbL-B57F

TACTCATTTTTGTACTTGSYGT

66659

63853

64704

61863

68769

64025

66911

15369

62735

35781

69677

63644

62054

psbF-56R

ATGAACTGCATTGCTGATATTG

66759

63952

64814

61963

68869

64125

67011

63184

62840

35670

69777

63744

61954

psbF-56F

GRTCAATATCAGCAATGCAGTTCAT

66783

63976

64838

61987

68893

64149

67035

63208

62864

35646

69801

63768

61930

NTCP32-f

TGTTTCATCTTTTTAGGTTTAT

73958

71252

64941

 

82632

74012

74192

 

 

 

76900

0

107580

psbE-r(FOF)

TACCTTCCCTATTCATTGCG

67050

64243

65110

62255

69160

64416

67302

 

63130

35379

70068

64036

61663

psbE-B55F

GTYATTCATAGYATTACTATACC

67069

64262

65129

62274

69179

64435

67321

 

63149

 

70087

61644

61644

psbE-55F

ATGTCTGGAAGCACRGGAGAACG

67129

64322

65189

62334

69239

64495

67381

 

63209

 

70147

64115

61584

rps18-f Grivet

GCTCGTATTTTATCTTTGTTACC

70722

68121

68887

65926

72937

67957

70975

 

66830

31869

74136

67838

58490

rps18-r Grivet

GGTAACAAAGATAAAATACGAGC

70744

68143

68909

65948

72959

67979

70997

 

66852

31847

74158

67860

58468

rpl20 Hamilton

TTTGTTCTACGTCTCCGAGC

71363

68819

69591

 

73624

68633

71621

 

 

 

74833

68581

0

rpL20 Shaw

CGYYAYCGAGCTATATATCC

71372

68828

69600

66677

 

 

71630

 

67528

31246

 

 

 

ccSSR-11 F

TTGGCTACTCTAACCTTCCC

71536

68983

69758

 

 

 

71794

 

 

 

 

 

 

ccmp8-f

TTGGCTACTCTAACCTTCCC

71536

68983

69768

 

 

 

71794

 

 

 

 

 

 

ccSSR-11 R

ACCATAGAAACGAWGGAACCCACT

71700

69124

69948

66927

73948

68925

71956

 

67862

30976

75165

 

57425

5'-rps12 Hamilton

GTCGAGGAACATGTACTAGG

72246

69632

70488

67415

74455

69447

72503

 

68357

 

75695

69332

56957

5'rpS12 Shaw

ATTAGAAANRCAAGACAGCCAAT

72313

69703

70555

67482

74522

69514

72570

 

68426

30402

75762

69399

56890

clpP-3'ex3

CAT AAA AAC ATC RTC CAT

72527

69964

70828

67752

74764

0

72784

67205

68637

30147

0

69668

0

NTCP30-f

GATGGCTCCGTTGCTTTAT

72945

70339

71242

 

75195

 

73195

 

69050

 

 

 

 

clpP-3'ex2r

GCNGCNYCAATGGGATCTTT

73406

 

71700

113209

75627

70706

73647

 

69471

29905

0

116957

0

clpP2-f

GTAATCTYTCWCGATAAAGTCGRTTG

73604

70919

71898

 

75825

 

73846

68026

69669

29707

 

 

 

NTCP29-f

AGTCGGTTGATTAGGGTAAAAT

73621

70936

71915

 

75842

70921

73863

 

69686

 

0

 

0

clpP-5'ex1

ATGCCTATTGGTGTNCCNAA

74507

71882

72808

 

76802

 

74741

68640

70604

 

 

 

 

psbB-60F

ATGGGTTTGCCTTGGTATCGTGTTCATAC

74953

72371

73334

68799

77207

72204

75183

69026

71047

52424

77341

70706

53898

psbB1-f (B1B2-B1)

TGCCTTGGTATCGTGTTCATAC

74960

72378

73341

68806

77214

72211

75190

69033

71054

52431

77348

70713

53891

PSBB Goulding

GATACCAAGGCAAACCC

74971

72389

73352

68817

77225

72222

75201

 

71065

52442

77359

70724

53880

psbB-r

ATAYACCCAATGCCARATAG

75303

72721

73684

69149

77557

72554

75533

69376

71397

52774

77691

71056

53548

psbB-61R

TCCCAATAYACCCAATGCCAGATAG

75308

72726

73689

69154

77562

72559

75538

69381

71402

52779

77696

71061

53543

rps5-M

CCATTAACTAAAATATGTYG

47783

45470

45900

 

49582

46336

47453

45567

44721

 

19137

47404

108655

rpS4R3 Shaw

CTGTNAGWCCRTAATGAAAACG

47958

45645

46075

45232

49757

46511

47628

41287

44897

69711

18962

47579

108830

ucp-a/trnT-f

CATTACAAATGCGATGCTCT

48546

46246

46515

45748

50164

47078

48206

 

45536

69214

18418

48114

109364

trnT(UGU)2F-trnA3

CAAATGCGATGCTCTAACCT

48551

46251

46520

45753

50169

47083

48211

 

45541

69209

18413

48119

109369

trnT-M

AGAGCATCGCATTTGTAATG

48565

46265

46534

45767

50183

47097

48225

 

45555

69195

18399

48133

109383

trnT(UGU)R Shaw

AGGTTAGAGCATCGCATTTG

48570

46270

46539

45772

50188

47102

48230

 

45560

69190

18394

48138

109388